RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 CNNM3Q8NE01 707 aa22.94■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 TMEM51Q9NW97 253 aa22.94■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 CUTAO60888 179 aa22.93■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 PTPN21Q16825 1174 aa22.93■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.93■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 SCNN1DP51172 638 aa22.93■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 RHBDL3P58872 404 aa22.93■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 PDILTQ8N807 584 aa22.93■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 CNKSR1Q969H4 720 aa22.93■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 CLIC6Q96NY7 704 aa22.93■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 TEX11Q8IYF3 940 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 EYA3Q99504 573 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 MAP3K14Q99558 947 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 INTS13Q9NVM9 706 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 MAP3K9P80192 1104 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 LONRF3Q496Y0 759 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 IQCA1Q86XH1 822 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.92■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 C21orf2O43822 256 aa22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 STX10O60499 249 aa22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 TRIM29Q14134 588 aa22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 TMTC2Q8N394 836 aa22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 TBC1D8O95759 1140 aa22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 PDE4BQ07343 736 aa22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 WDR24Q96S15 920 aa22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.91■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 ORC4O43929 436 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 MTA3Q9BTC8 594 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 GAKO14976 1311 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 TSPY2A6NKD2 308 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 RTN1Q16799 776 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 AOC3Q16853 763 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 FANCBQ8NB91 859 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 EPC1Q9H2F5 836 aa22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VGF-201ENST00000249330 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.89■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.89■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 SLF2Q8IX21 1173 aa22.89■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 SASH3O75995 380 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 GUCY1A2P33402 732 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 PODNQ7Z5L7 613 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 RABGGTAQ92696 567 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 FLT1P17948 1338 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 TFAP4Q01664 338 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 GPS2Q13227 327 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 TC2NQ8N9U0 490 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 GOLGA1Q92805 767 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 DACH1Q9UI36 760 aa22.88■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 TULP2O00295 520 aa22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 PICALMQ13492 652 aa22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 ECE2O60344 883 aa22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 ZBTB7AO95365 584 aa22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 BMP6P22004 513 aa22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 NEK11Q8NG66 645 aa22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 KIFC2Q96AC6 838 aa22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.87■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 LAMB1P07942 1786 aa22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 PLCG2P16885 1265 aa22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 IFNAR1P17181 557 aa22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.86■■□□□ 1.25
VGF-201ENST00000249330 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms