RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM1O75626 825 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GH2P01242 217 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CTDSPL2Q05D32 466 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC186Q7Z3E2 898 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 DRC7Q8IY82 874 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A4AQ96JQ5 239 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 FEZ1Q99689 392 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF165P49910 485 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 RESTQ13127 1097 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 THSD7BQ9C0I4 1608 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PPARAQ07869 468 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 AMOTL1Q8IY63 956 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 BICD2Q8TD16 824 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 NEK1Q96PY6 1258 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMB1P07942 1786 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 HAND2P61296 217 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PPATQ06203 517 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 DGKZQ13574 1117 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH8P13535 1937 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR1B1P15121 316 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GUCY1A2P33402 732 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ALX1Q15699 326 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CKAP2LQ8IYA6 745 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN18Q99952 460 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIL2Q13356 520 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC10AQ8IUN9 316 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM75PA6NK02 468 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF3Q9H094 633 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BQV1 296 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCB5Q2M3G0 1257 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 IFFO2Q5TF58 517 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX2-3Q8TAU0 364 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 BRI3BPQ8WY22 251 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SWAP70Q9UH65 585 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ROBO3Q96MS0 1386 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM173BQ6P4H8 233 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PGBD1Q96JS3 809 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP30.26■■■□□ 2.445e-7■■■■□ 22.6
CAPNS1-201ENST00000246533 NR1I2O75469 434 aa30.26■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ASNSP08243 561 aa30.26■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SPP2Q13103 211 aa30.26■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SEPT2Q15019 361 aa30.26■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa30.26■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 TSC1Q92574 1164 aa30.26■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 WBP1LQ9NX94 342 aa30.26■■■□□ 2.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 RASA1P20936 1047 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CLIP2Q9UDT6 1046 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TSKSQ9UJT2 592 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH15Q9Y2K3 1946 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 BRF1Q92994 677 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNH4Q9UQ05 1017 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L5A8MUK1 530 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TM4SF4P48230 202 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 MOGSQ13724 837 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 STX1AQ16623 288 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 DSCC1Q9BVC3 393 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 MKNK2Q9HBH9 465 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRFP10586 1907 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL15Q16663 113 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 RCOR1Q9UKL0 485 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 PFKFB2O60825 505 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2A2P52657 109 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D10CQ8IV04 446 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF280CQ8ND82 737 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ACER1Q8TDN7 264 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 STK3Q13188 491 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAPC2Q13487 334 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM47AQ5JRC9 791 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC25Q9H1X3 360 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ANAPC4Q9UJX5 808 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMYM6O95789 1325 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPA1O75762 1119 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TNNT1P13805 278 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZUG5 572 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TCEANC2Q96MN5 208 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CABP5Q9NP86 173 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF6LQ9Y6J9 622 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCB1Q15051 598 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNL1Q8IU54 200 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-201ENST00000246533 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms