RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040924.7

Ss18-201, Transcript of Protein SSXT, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ss18, Length 3,090 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18-201ENSMUST00000040924 GabrdP22933 449 aa16.09■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Mybl1P51960 751 aa16.09■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 NfixP70257 488 aa16.09■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa16.09■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ccdc181Q80ZU5 509 aa16.09■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Znf445Q8R2V3 986 aa16.09■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa16.09■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa16.08■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Impdh2P24547 514 aa16.08■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Pde6aP27664 859 aa16.08■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Cdr2P97817 455 aa16.08■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Plbd2Q3TCN2 594 aa16.08■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tbc1d1Q60949 1255 aa16.08■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tsga10Q6NY15 697 aa16.08■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ttc12Q8BW49 704 aa16.08■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gkap1Q9JMB0 366 aa16.08■□□□□ 0.17
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Usp53P15975 1069 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Lrsam1Q80ZI6 727 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 ToporslQ9D2F8 683 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Foxo3Q9WVH4 672 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Rad23aP54726 363 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Surf6P70279 355 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Emc10Q3TAS6 258 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ugt1a6Q64435 531 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Uap1Q91YN5 522 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 BrapQ99MP8 591 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ankrd1Q9CR42 319 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Kcnq5Q9JK45 933 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Entpd5Q9WUZ9 427 aa16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Vmn2r78K7N6U5 853 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Metap2O08663 478 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gas2l3Q3UWW6 683 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ces3aQ63880 571 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 PnocQ64387 187 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Zfp202Q8C879 641 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ces3bQ8VCU1 571 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Etnk1Q9D4V0 363 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ube3bQ9ES34 1070 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Setdb1O88974 1307 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gm7347D3YYI9 267 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Speer4aF8VPX6 267 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Myo1aO88329 1043 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Krt39Q6IFX4 482 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 B4galnt4Q766D5 1034 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Slc14a2Q8R4T9 930 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 CpzQ8R4V4 654 aa16.07■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Znf428Q8C1M2 176 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gcom1E9PZ54 550 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Dok7Q18PE0 504 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 MyzapQ3UIJ9 466 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ctdp1Q7TSG2 960 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Mettl5Q8K1A0 209 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Dnajc28Q8VCE1 385 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Stk38Q91VJ4 465 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Mast3Q3U214 1321 aa16.06■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Vipas39Q8BGQ1 491 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tfcp2Q9ERA0 502 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Kdm7aQ3UWM4 940 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Arid3aQ62431 601 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gimap8Q75N62 688 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tpcn2Q8BWC0 731 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Enc1O35709 589 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Myo1fP70248 1099 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Mum1l1Q4VA55 681 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Rps6ka6Q7TPS0 764 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Uts2Q9QZQ3 123 aa16.05■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ankrd63A2ARS0 390 aa16.04■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Grin1P35438 938 aa16.04■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ncaph2Q8BSP2 607 aa16.04■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tc2nQ91XT6 489 aa16.04■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Lrp6O88572 1613 aa16.04■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gm10134F6ZQC6 126 aa16.04■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Camsap3Q80VC9 1252 aa16.04■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Naa16Q9DBB4 864 aa16.04■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Fer1l6E0CZ42 1862 aa16.04■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Zfy1P10925 782 aa16.03■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Sorbs1Q62417 1290 aa16.03■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa16.03■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Fam173bQ9D1Z3 247 aa16.03■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 FliiQ9JJ28 1271 aa16.03■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Vstm4T1NXB5 319 aa16.03■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Top1Q04750 767 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 PsdQ5DTT2 1024 aa16.03■□□□□ 0.16
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tbx2Q60707 711 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 1313.8 ms