RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	RAD55	P38953	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	IRC6	P43615	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	NIT2	P47016	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TAH11	P47112	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TAM41	P53230	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MMT1	Q03218	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SEG1	Q04279	960 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PMA2	P19657	947 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GRR1	P24814	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MLS1	P30952	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	STE5	P32917	917 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	HCS1	P34243	683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RET2	P43621	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SAP4	P53036	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GPI1	P53306	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ADK2	P26364	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PHA2	P32452	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	BIG1	P38813	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SFP1	P32432	683 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SLA2	P33338	968 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	DAK2	P43550	591 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TAF6	P53040	516 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ECM7	Q06200	448 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	VAN1	P23642	535 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	KIP2	P28743	706 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	DGR2	P32330	852 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SWC5	P38326	303 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MBP1	P39678	833 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YEL028W	P39989	153 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ATM1	P40416	690 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	EMC1	P25574	760 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	KAR9	P32526	644 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YHR035W	P38769	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FMC1	P40491	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	NUP84	P52891	726 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MNT4	P53745	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	GPR1	Q12361	961 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	AFI1	Q99222	893 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	OAF3	P36023	863 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RDH54	P38086	958 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YSP3	P25036	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ARA1	P38115	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	AXL1	P40851	1208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SPC98	P53540	846 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SMA1	Q02651	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RPN4	Q03465	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	VHS1	Q03785	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	EMI1	Q04406	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SPC2	Q04969	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	BBP1	Q12365	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SNF3	P10870	884 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PGS1	P25578	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MAD2	P40958	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YJR124C	P47159	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	NGL3	Q03210	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TSA2	Q04120	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YKU80	Q04437	629 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TCA17	P32613	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	HOL1	P53389	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YPD1	Q07688	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SPS4	P09937	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	STE6	P12866	1290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	DIT1	P21623	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RAD16	P31244	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	IML2	P47031	731 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	AAD10	P47182	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ORC5	P50874	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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