RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	TM4SF20	Q53R12	229 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	RASIP1	Q5U651	963 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATC1	Q76KD6	591 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	NKD1	Q969G9	470 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CBX8	Q9HC52	389 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC189	A1A4V9	331 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616		F8W735	103 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	RLBP1	P12271	317 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	STAT3	P40763	770 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	LIG3	P49916	1009 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	ADGRE1	Q14246	886 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	LONRF3	Q496Y0	759 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		6.43	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	MEGF11	A6BM72	1044 aa		6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CAND2	O75155	1236 aa		6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CHRNA4	P43681	627 aa		6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC14	Q15048	493 aa		6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP2R5A	Q15172	486 aa		6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087X0B3	334 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	ALG1L2	C9J202	215 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	MAFG	O15525	162 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	ALX3	O95076	343 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	GJB6	O95452	261 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	PML	P29590	882 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE3A	Q14432	1141 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	MBTPS1	Q14703	1052 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	SEZ6	Q53EL9	994 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CD163	Q86VB7	1156 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	MFSD3	Q96ES6	412 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF208	Q9H0X6	261 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT82	Q9NSB4	513 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	ASXL2	Q76L83	1435 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	TIAM1	Q13009	1591 aa		6.41	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	SHTN1	A0MZ66	631 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	PLIN1	O60240	522 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	SCGB1D2	O95969	90 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	NOS3	P29474	1203 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	LMNB2	Q03252	620 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	MCL1	Q07820	350 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		6.4	□□□□□ -1.38
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		6.4	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	GLI2	P10070	1586 aa		6.4	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		6.4	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF862	O60290	1169 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	COBL	O75128	1261 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	LIG1	P18858	919 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39

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