RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636350.1

CACNB4-222, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 7,654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-222	ENST00000636350	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	NOX5	Q96PH1	765 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SMTN	P53814	917 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	IDI1	Q13907	227 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	ELF2	Q15723	593 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SNCB	Q16143	134 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	DBN1	Q16643	649 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC114	Q96M63	670 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	LRGUK	Q96M69	825 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	OLFM3	Q96PB7	478 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	TMEM51	Q9NW97	253 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	HPSE	Q9Y251	543 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	GRM8	O00222	908 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	RWDD2B	P57060	319 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	PARP10	Q53GL7	1025 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	BANK1	Q8NDB2	785 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	TRIM11	Q96F44	468 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SENP1	Q9P0U3	644 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	UBE4B	O95155	1302 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	MYBPC2	Q14324	1141 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	TNNI3K	Q59H18	835 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC174	Q6PII3	467 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	PASD1	Q8IV76	773 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	DNAJC7	Q99615	494 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	GAS8	O95995	478 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	3.68	□□□□□ -1.82	4e-6	■■□□□ 13.2
CACNB4-222	ENST00000636350	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	CDK18	Q07002	472 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	COG1	Q8WTW3	980 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	CSRNP2	Q9H175	543 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	PFAS	O15067	1338 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	PTPRE	P23469	700 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	MTR	Q99707	1265 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	MIS12	Q9H081	205 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	PAK1	Q13153	545 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	WDR78	Q5VTH9	848 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	ARMC3	Q5W041	872 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	KRT39	Q6A163	491 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	ERMN	Q8TAM6	284 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	ESR2	Q92731	530 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	USP16	Q9Y5T5	823 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CACNB4-222	ENST00000636350	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		3.67	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms