RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	CYP27A1	Q02318	531 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	C2orf27A	Q580R0	203 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	JMY	Q8N9B5	988 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	DCAF5	Q96JK2	942 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	APBA2	Q99767	749 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	HAUS7	Q99871	368 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EP300-208	ENST00000635538	KIR3DL1	P43629	444 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CHRNA4	P43681	627 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	GATA4	P43694	442 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CD163	Q86VB7	1156 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	HOMER1	Q86YM7	354 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	APPBP2	Q92624	585 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	WHRN	Q9P202	907 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	RAX	Q9Y2V3	346 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538		A0A087WZG4	1122 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538		C9IYK1	514 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	PPM1B	O75688	479 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CDK5R2	Q13319	367 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CDH24	Q86UP0	819 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	VWCE	Q96DN2	955 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	TMEM260	Q9NX78	707 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	STOML1	Q9UBI4	398 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CDC45	O75419	566 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	EPHX1	P07099	455 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	ITGA4	P13612	1032 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SV2C	Q496J9	727 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	ZAR1	Q86SH2	424 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	LILRB2	Q8N423	598 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	LGR6	Q9HBX8	967 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	GSC2	O15499	205 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CBFA2T2	O43439	604 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	EOMES	O95936	686 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	FAM87A	P0C7U9	286 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	CD247	P20963	164 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	KCNMA1	Q12791	1236 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SPATC1	Q76KD6	591 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	TP53INP1	Q96A56	240 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	DCAF15	Q66K64	600 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SLC51A	Q86UW1	340 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	RIN3	Q8TB24	985 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	GP6	Q9HCN6	339 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	FANCL	Q9NW38	375 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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