RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629343.2

TCF4-267, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-267	ENST00000629343	SEC23A	Q15436	765 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	FOXN1	O15353	648 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	CYP2C8	P10632	490 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ATP2B2	Q01814	1243 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	TRDN	Q13061	729 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	C17orf99	Q6UX52	265 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	LPAR1	Q92633	364 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	TLR2	O60603	784 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	NDUFB10	O96000	172 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	VCAM1	P19320	739 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	CRHR2	Q13324	411 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	COG2	Q14746	738 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	IQCA1	Q86XH1	822 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	FEZ1	Q99689	392 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	SH2D4A	Q9H788	454 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	GPR25	O00155	361 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	OSBP	P22059	807 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	MCC	P23508	829 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-267	ENST00000629343	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	SNHG28	P0DPA3	235 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	BCR	P11274	1271 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	DSG3	P32926	999 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	MCM5	P33992	734 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	KRT32	Q14532	448 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343		Q3C1V9	767 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	LBX2	Q6XYB7	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	TNKS	O95271	1327 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	PRC1	O43663	620 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	PLA2G6	O60733	806 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	LBX1	P52954	281 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	HERVK_113	P62684	666 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	CAP1	Q01518	475 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-267	ENST00000629343	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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