RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614056.4

PDCD2-215, Transcript of programmed cell death 2, human

TSL 2 BASIC

Gene PDCD2, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD2-215	ENST00000614056	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	33.17	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056		A0A1W2PPC1	479 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	HAUS7	Q99871	368 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	SWAP70	Q9UH65	585 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	COG2	Q14746	738 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	SMIM22	K7EJ46	135 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	AKR1B1	P15121	316 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	ATP2B2	Q01814	1243 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	GRB14	Q14449	540 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	RLF	Q13129	1914 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDCD2-215	ENST00000614056	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	GDF15	Q99988	308 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056		A0A0G2JMZ2	1700 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	CNGA1	P29973	690 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	ICA1	Q05084	483 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	LRCH3	Q96II8	777 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	COL6A1	P12109	1028 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	CYP2C19	P33261	490 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	USP17L12	C9JPN9	530 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	USP17L21	D6R901	530 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	C12orf60	Q5U649	245 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	HOXC6	P09630	235 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	CDK8	P49336	464 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	PLS1	Q14651	629 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	DPP9	Q86TI2	863 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	FLOT1	O75955	427 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	BMP8B	P34820	402 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	UBE3C	Q15386	1083 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	SH2D4A	Q9H788	454 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PDCD2-215	ENST00000614056	ERCC3	P19447	782 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	ADORA2A	P29274	412 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	DSG3	P32926	999 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	LPAR1	Q92633	364 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	ATG4C	Q96DT6	458 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	VCPKMT	Q9H867	229 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	TMX2	Q9Y320	296 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	PARP14	Q460N5	1801 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	TRPV1	Q8NER1	839 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	CCDC17	Q96LX7	622 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	CTR9	Q6PD62	1173 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	MB21D1	Q8N884	522 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	STRN	O43815	780 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	RAD21	O60216	631 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	MSC	O60682	206 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	COBL	O75128	1261 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	CYBA	P13498	195 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PDCD2-215	ENST00000614056	MROH8	Q9H579	483 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	LAMA3	Q16787	3333 aa		33	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	ANO1	Q5XXA6	986 aa		33	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		33	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		33	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	IGHA2	P01877	340 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	TDH	Q8IZJ6	230 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PDCD2-215	ENST00000614056	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87

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