RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613894.3

CU633980.1-201, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CU633980.1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633980.1-201ENST00000613894 PLEKHG3A1L390 1219 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 HSF2BPO75031 334 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 CASP14P31944 242 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 PDCLQ13371 301 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 TTC39AQ5SRH9 613 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 CYB5D1Q6P9G0 228 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 FAM210AQ96ND0 272 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 EYA1Q99502 592 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.74□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 KIF1AQ12756 1690 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 PLCH1Q4KWH8 1693 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 PPP1R37O75864 691 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 FAM107AO95990 144 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 CUL4BQ13620 913 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 SKIDA1Q1XH10 827 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 AP1ARQ63HQ0 302 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 PPP4R3AQ6IN85 833 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 KSR2Q6VAB6 950 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 KIAA1328Q86T90 577 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 FAM228AQ86W67 206 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 FUKQ8N0W3 1084 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 KBTBD3Q8NAB2 608 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 KAZALD1Q96I82 304 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 ETAA1Q9NY74 926 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 PRR36Q9H6K5 1346 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 GRM8O00222 908 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 YY1P25490 414 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 RWDD2BP57060 319 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 XRCC4Q13426 336 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 WASHC4Q2M389 1173 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 NLRP14Q86W24 1093 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 MREGQ8N565 214 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 LINS1Q8NG48 757 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 TCP11Q8WWU5 503 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 SUCLG2Q96I99 432 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 RUFY1Q96T51 708 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 SLC24A3Q9HC58 644 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 TNS3Q68CZ2 1445 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.72□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 LRRC10BA6NIK2 292 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 IRF6O14896 467 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 NDUFA10O95299 355 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 ABL1P00519 1130 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 GHRP10912 638 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 SPAG1Q07617 926 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 TTLL7Q6ZT98 887 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 VPS37DQ86XT2 251 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 ITFG2Q969R8 447 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 JAKMIP2Q96AA8 810 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 ARL8AQ96BM9 186 aa12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CU633980.1-201ENST00000613894 CPDO75976 1380 aa12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 MGRN1O60291 552 aa12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PRLRP16471 622 aa12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC114Q96M63 670 aa12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CCT8L2Q96SF2 557 aa12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 COPRSQ9NQ92 184 aa12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 FOXN1O15353 648 aa12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CDKL5O76039 1030 aa12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms