RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608263.5

CTCFL-216, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 4,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-216ENST00000608263 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 GPR108Q9NPR9 543 aa11.66□□□□□ -0.54
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CTCFL-216ENST00000608263 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.64□□□□□ -0.55
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CTCFL-216ENST00000608263 PALLDQ8WX93 1383 aa11.63□□□□□ -0.55
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CTCFL-216ENST00000608263 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 MMP10P09238 476 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.551e-7■■□□□ 12.2
CTCFL-216ENST00000608263 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 SPATA1Q5VX52 437 aa11.63□□□□□ -0.55
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