RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 NEDD4P46934 1319 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 H7C1D1 291 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 J3QL48 77 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 EPHX2P34913 555 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 HPS1Q92902 700 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR90Q96KV7 1748 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 B4E1Z4 1266 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 E7EWF7 191 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF213O14771 459 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 GNAT2P19087 354 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 JAG1P78504 1218 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKG1Q13976 671 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM47AQ5JRC9 791 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf60Q5U649 245 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CHMP4CQ96CF2 233 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MRIQ9BWK5 157 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TOMM22Q9NS69 142 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAF5O00463 557 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 NMT2O60551 498 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CASTP20810 708 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MCCP23508 829 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT7BP56706 349 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ANTXR2P58335 489 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RASA3Q14644 834 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ALX1Q15699 326 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 BRICD5Q6PL45 260 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 USP48Q86UV5 1035 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNB2Q92953 911 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 IDI2Q9BXS1 227 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC18Q9H819 358 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.15□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO1BO43795 1136 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM4AO75164 1064 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ENTPD3O75355 529 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 GDF11O95390 407 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 AKR1B1P15121 316 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 SCN4AP35499 1836 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK8P49336 464 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 SBK1Q52WX2 424 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 MOB2Q70IA6 237 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TICAM2Q86XR7 235 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM151AQ8WW52 585 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TEPSINQ96N21 525 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 NEK1Q96PY6 1258 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 CSRNP1Q96S65 589 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMYM6O95789 1325 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 PRC1O43663 620 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 LARGE1O95461 756 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHA1P01876 353 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 RASA1P20936 1047 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 SHMT1P34896 483 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 NEK4P51957 841 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 AK2P54819 239 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 Q3C1V9 767 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.13□□□□□ -1.27
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