RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATC1LQ9H0A9 340 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 COBLO75128 1261 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 TNNI3KQ59H18 835 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 NCAPG2Q86XI2 1143 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 PPM1EQ8WY54 764 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 EHD4Q9H223 541 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 MYH1P12882 1939 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 FPGSQ05932 587 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 RARBP10826 455 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAJB2P25686 324 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 EPHB4P54760 987 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 C1orf53Q5VUE5 145 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 CERS3Q8IU89 383 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 USP38Q8NB14 1042 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 SHCBP1Q8NEM2 672 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM39AQ9NV64 488 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 IGHA2P01877 340 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 ITGB8P26012 769 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 SEPT2Q15019 361 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF180Q86T96 592 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 IGSF3O75054 1194 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 MROH8Q9H579 483 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR108Q9NPR9 543 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 PHF24Q9UPV7 400 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 MAML3Q96JK9 1138 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF576Q9H609 170 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 PGK1P00558 417 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 FCER1AP12319 257 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 SHMT1P34896 483 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 MB21D1Q8N884 522 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 TIFAQ96CG3 184 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA0355O15063 1070 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 FLOT1O75955 427 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 PLCD1P51178 756 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF236Q9UL36 1845 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 GUCY1A2P33402 732 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ABRAQ8N0Z2 381 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PQY0 241 aa26.47■■□□□ 1.83
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CAPNS1-205ENST00000588780 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 MAP3K12Q12852 859 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 IL27Q8NEV9 243 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PRG0 241 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 DSG3P32926 999 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ATG4CQ96DT6 458 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 MMP19Q99542 508 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 CDH23Q9H251 3354 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-205ENST00000588780 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 PGK2P07205 417 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 STARD7Q9NQZ5 370 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 THEGQ9P2T0 379 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 KCTD2Q14681 263 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC174Q6PII3 467 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 PRDM12Q9H4Q4 367 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC25A27O95847 323 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 AKR1A1P14550 325 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 FAAP100Q0VG06 881 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 NUP133Q8WUM0 1156 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TINF2Q9BSI4 451 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 BCAR3O75815 825 aa26.41■■□□□ 1.82
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