RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CEP95Q96GE4 821 aa30.47■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PPP1R9BQ96SB3 815 aa30.47■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CTAGE5O15320 804 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KINO60870 393 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HLA-DOAP06340 250 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PSME4Q14997 1843 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYH8P13535 1937 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TOP1P11387 765 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UVSSAQ2YD98 709 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BRMS1Q9HCU9 246 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LZTS2Q9BRK4 669 aa30.45■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IDI2Q9BXS1 227 aa30.45■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EHD4Q9H223 541 aa30.45■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UTRNP46939 3433 aa30.45■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CMA1P23946 247 aa30.44■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A1B0GVL5 298 aa30.43■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NPM3O75607 178 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TYRO3Q06418 890 aa30.43■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NDUFA8P51970 172 aa30.43■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NPY5RQ15761 445 aa30.43■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa30.42■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AKR1B1P15121 316 aa30.42■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SHMT1P34896 483 aa30.42■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CABP5Q9NP86 173 aa30.42■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MTMR4Q9NYA4 1195 aa30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MRVI1Q9Y6F6 885 aa30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TGFB2P61812 414 aa30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZFPM1Q8IX07 1006 aa30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PIBF1Q8WXW3 757 aa30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VPS33BQ9H267 617 aa30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SH3GLB2Q9NR46 395 aa30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM198AQ9UFP1 575 aa30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MTMR7Q9Y216 660 aa30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CUTAO60888 179 aa30.4■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CACNB3P54284 484 aa30.4■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC35G1Q2M3R5 365 aa30.4■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SOGA3Q5TF21 947 aa30.4■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SASS6Q6UVJ0 657 aa30.4■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TNFRSF25Q93038 417 aa30.4■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NLRP5P59047 1200 aa30.39■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.39■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PDLIM2Q96JY6 352 aa30.39■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KLRF2D3W0D1 207 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CYTH3O43739 400 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPZ1Q9BXG8 430 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CEP131Q9UPN4 1083 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SIPA1L1O43166 1804 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PFKFB1P16118 471 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TCP10Q12799 353 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CFAP100Q494V2 611 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CALML3P27482 149 aa30.37■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SHC4Q6S5L8 630 aa30.37■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PIM2Q9P1W9 311 aa30.37■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM205CA6NFA0 338 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GOLGA8HP0CJ92 632 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SMARCA1P28370 1054 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RESP18Q5W5W9 173 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM200AQ8TCP9 573 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC17Q96LX7 622 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 COL4A5P29400 1685 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 USP17L2Q6R6M4 530 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RASGRP2Q7LDG7 609 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PI4KBQ9UBF8 816 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HPSEQ9Y251 543 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF202O95125 648 aa30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TTLL1O95922 423 aa30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VIL1P09327 827 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DNAJC18Q9H819 358 aa30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRIM75PA6NK02 468 aa30.34■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTPREP23469 700 aa30.34■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CLIC6Q96NY7 704 aa30.34■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SDF4Q9BRK5 362 aa30.34■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PSMD14O00487 310 aa30.33■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ENTPD3O75355 529 aa30.33■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RAD17O75943 681 aa30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms