RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 USP17L21D6R901 530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 USP17L18D6R9N7 530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 USP17L22D6RA61 530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 USP17L17D6RBQ6 530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 USP17L19D6RCP7 530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 USP17L20D6RJB6 530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 H7C1W4 665 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 LILRA1O75019 489 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 ATG7O95352 703 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 DDX58O95786 925 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 CTGFP29279 349 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 SCTRP47872 440 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 SP3Q02447 781 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 USP17L24Q0WX57 530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 VGLL4Q14135 290 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 KSR2Q6VAB6 950 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 OPTNQ96CV9 577 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 TEPSINQ96N21 525 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 AK9Q5TCS8 1911 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 DNAH12Q6ZR08 3092 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 KCNJ4P48050 445 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 CBLBQ13191 982 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 ANKRD2Q9GZV1 360 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 ATAD5Q96QE3 1844 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 TCP10L2B9ZVM9 353 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 F6X3S4 739 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRM-206ENST00000578093 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 MPHOSPH8Q99549 860 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 PRO3102Q9H379 93 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 CUL9Q8IWT3 2517 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-206ENST00000578093 PLXNB2O15031 1838 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRM-206ENST00000578093 FRMPD3Q5JV73 1810 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRM-206ENST00000578093 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.02□□□□□ -1.61
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