RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 NLRP5P59047 1200 aa26.47■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.47■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 SPATA20Q8TB22 786 aa26.47■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 DHX58Q96C10 678 aa26.47■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 DACH1Q9UI36 760 aa26.47■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 ZNF827Q17R98 1081 aa26.46■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 CEP135Q66GS9 1140 aa26.46■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 CERKQ8TCT0 537 aa26.46■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.46■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 CFAP100Q494V2 611 aa26.46■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 CTIFO43310 598 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 LDHCP07864 332 aa26.45■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 CRY2Q49AN0 593 aa26.45■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.45■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 PNMA1Q8ND90 353 aa26.45■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.45■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 PTPN14Q15678 1187 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 VSTM4Q8IW00 320 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 ADAMTS3O15072 1205 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 UFL1O94874 794 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 SLFN14P0C7P3 912 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 TRAPPC10P48553 1259 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 PTGDRQ13258 359 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 GRM4Q14833 912 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 GYS1P13807 737 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 CD209Q9NNX6 404 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 USP17L3A6NCW0 530 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 USP17L4A6NCW7 530 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 ATP2B4P23634 1241 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 KCNJ6P48051 423 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 ST5P78524 1137 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 PAGE5Q96GU1 130 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 AFF2P51816 1311 aa26.42■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.42■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 TMEM232C9JQI7 657 aa26.42■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 ZNF18P17022 549 aa26.42■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 PLCD1P51178 756 aa26.42■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
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EHD4-202ENST00000569223 INTS13Q9NVM9 706 aa26.42■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.42■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 NRDCO43847 1150 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 SERPINB2P05120 415 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 TSPY3P0CV98 308 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 TSPY8P0CW00 308 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 CALML3P27482 149 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 GGA1Q9UJY5 639 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 IL1R1P14778 569 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 AFMP43652 599 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 ZNF592Q92610 1267 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 MED15Q96RN5 788 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 BTDP43251 543 aa26.4■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 BLIDQ8IZY5 108 aa26.4■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 CCDC112Q8NEF3 446 aa26.4■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 RASA1P20936 1047 aa26.39■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 GNAQP50148 359 aa26.39■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 CERS3Q8IU89 383 aa26.39■■□□□ 1.82
EHD4-202ENST00000569223 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa26.39■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.39■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 MCM7P33993 719 aa26.38■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 DPYDQ12882 1025 aa26.38■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.38■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.38■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.38■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 IL17AQ16552 155 aa26.38■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.38■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
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