RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPATCH3Q96I76 525 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 SWAP70Q9UH65 585 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.63□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE3CQ15386 1083 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 C12orf60Q5U649 245 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTR9Q6PD62 1173 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.62□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ATG4CQ96DT6 458 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.62□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 M0R2C6 588 aa8.61□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP2C19P33261 490 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.61□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 OSBP2Q969R2 916 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCTPP1Q9H773 170 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH2D4AQ9H788 454 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.61□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PARP14Q460N5 1801 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 MINDY4BA8MYZ0 360 aa8.6□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PRDM1O75626 825 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERCC3P19447 782 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTPREP23469 700 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADORA2AP29274 412 aa8.6□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ANO1Q5XXA6 986 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 LBX2Q6XYB7 198 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.6□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 APPBP2Q92624 585 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 NBPF3Q9H094 633 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 VCPKMTQ9H867 229 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 STAP2Q9UGK3 403 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMX2Q9Y320 296 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 APPP05067 770 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASA1P20936 1047 aa8.59□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 DPP9Q86TI2 863 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 LPAR1Q92633 364 aa8.59□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC17Q96LX7 622 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRBNQ96SW2 442 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 FSD1Q9BTV5 496 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MX1P20591 662 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC4A3P48751 1232 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 LHX8Q68G74 356 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRPV1Q8NER1 839 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.58□□□□□ -1.04
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