RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566253.5

MAN2C1-231, Transcript of mannosidase alpha class 2C member 1, human

TSL 4

Gene MAN2C1, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAN2C1-231	ENST00000566253	TDO2	P48775	406 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	PDE1A	P54750	535 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	ATP2B2	Q01814	1243 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	COG2	Q14746	738 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	LBX2	Q6XYB7	198 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	GPR142	Q7Z601	462 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	SH2D4A	Q9H788	454 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	BTBD7	Q9P203	1132 aa		14.56	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	SGPL1	O95470	568 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	HMGCR	P04035	888 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	RASA1	P20936	1047 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	CCNA1	P78396	465 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	TRIM32	Q13049	653 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	LPAR1	Q92633	364 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	DEFB118	Q96PH6	123 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	LNPK	Q9C0E8	428 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	VCPKMT	Q9H867	229 aa		14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	IGHD	P01880	384 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	MORN1	Q5T089	497 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	WDR78	Q5VTH9	848 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	SMC5	Q8IY18	1101 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	TRIB2	Q92519	343 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	USP6NL	Q92738	828 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	EVI5L	Q96CN4	794 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		14.54	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	FLOT1	O75955	427 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	RPTOR	Q8N122	1335 aa		14.52	□□□□□ -0.08
MAN2C1-231	ENST00000566253	RAD21	O60216	631 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	PRDM1	O75626	825 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	DSG3	P32926	999 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	RGS2	P41220	211 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	CCL14	Q16627	93 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	NAPB	Q9H115	298 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	GOPC	Q9HD26	462 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	RLF	Q13129	1914 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	PTPRE	P23469	700 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	MAP2K5	Q13163	448 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	ATG4C	Q96DT6	458 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	FOXP2	O15409	715 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	NUCB1	Q02818	461 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	PPARA	Q07869	468 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	PLS1	Q14651	629 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	MB21D1	Q8N884	522 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	APBA2	Q99767	749 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	NYAP2	Q9P242	653 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253		F5H6K3	240 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	CAPN2	P17655	700 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	ERCC3	P19447	782 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	PDE4B	Q07343	736 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	KLRC3	Q07444	240 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	VPS53	Q5VIR6	699 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MAN2C1-231	ENST00000566253	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		14.49	□□□□□ -0.09

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