RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.42■■□□□ 1.18
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CTU2-204ENST00000564105 ME3Q16798 604 aa22.42■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.42■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 MKL1Q969V6 931 aa22.42■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
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CTU2-204ENST00000564105 FOXN1O15353 648 aa22.41■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 LARGE1O95461 756 aa22.41■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 BECN1Q14457 450 aa22.41■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.41■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 MYL10Q9BUA6 226 aa22.41■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.4■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB43O43298 467 aa22.4■■□□□ 1.18
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CTU2-204ENST00000564105 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.4■■□□□ 1.18
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CTU2-204ENST00000564105 ACER1Q8TDN7 264 aa22.4■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 TMX3Q96JJ7 454 aa22.4■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.4■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.4■■□□□ 1.18
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CTU2-204ENST00000564105 A0A1W2PRG0 241 aa22.39■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.39■■□□□ 1.18
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CTU2-204ENST00000564105 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
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CTU2-204ENST00000564105 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.39■■□□□ 1.18
CTU2-204ENST00000564105 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.39■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 DDAH1O94760 285 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 TROAPQ12815 778 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 SH2D4AQ9H788 454 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 CALM1P0DP23 149 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 CALM3P0DP25 149 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 WBP1LQ9NX94 342 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.38■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.37■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 NECAB1Q8N987 351 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 CAPNS2Q96L46 248 aa22.36■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 USP17L10C9JJH3 530 aa22.35■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 MAP3K14Q99558 947 aa22.35■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 F5H6K3 240 aa22.34■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 KLRC3Q07444 240 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 GRM4Q14833 912 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 RTN1Q16799 776 aa22.34■■□□□ 1.17
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CTU2-204ENST00000564105 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 OTUD5Q96G74 571 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 VCPKMTQ9H867 229 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 RLFQ13129 1914 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 TRIM75PA6NK02 468 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 BACE1P56817 501 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-204ENST00000564105 HUNKP57058 714 aa22.33■■□□□ 1.17
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