RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 FCGRTP55899 365 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 SOX10P56693 466 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 ACER1Q8TDN7 264 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCDC17Q96LX7 622 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A1W2PRG0 241 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 M0R2C6 588 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 AKR1B1P15121 316 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 CDK8P49336 464 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUCB1Q02818 461 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 IRF5Q13568 498 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 SEPT2Q15019 361 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 LBX2Q6XYB7 198 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 NBPF11Q86T75 865 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 RLFQ13129 1914 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 MYPNQ86TC9 1320 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 USP17L15C9J2P7 530 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 USP17L11C9JVI0 530 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 USP17L18D6R9N7 530 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 USP17L22D6RA61 530 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 USP17L19D6RCP7 530 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 USP17L20D6RJB6 530 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 FOXP2O15409 715 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 VCAM1P19320 739 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 HERVK_113P62684 666 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRKCZQ05513 592 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 USP17L24Q0WX57 530 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 EVI5LQ96CN4 794 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 FSD1Q9BTV5 496 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 GABRQQ9UN88 632 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 PLXNB2O15031 1838 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 BRCA2P51587 3418 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 RASA1P20936 1047 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 GRK4P32298 578 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 FLT3LGP49771 235 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAET1EQ8TD07 263 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 FEZ1Q99689 392 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 LNPKQ9C0E8 428 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 GJD2Q9UKL4 321 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMX2Q9Y320 296 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 PARP14Q460N5 1801 aa8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 CEP290O15078 2479 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 CNMDO75829 334 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 ERVK-9P63128 1117 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 ERVK-24P63145 666 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 ICA1Q05084 483 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 Q3C1V9 767 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 LPAR1Q92633 364 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 COA7Q96BR5 231 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 VCPKMTQ9H867 229 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.86□□□□□ -0.99
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms