RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 COG3Q96JB2 828 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 TESK2Q96S53 571 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 J3QW42 95 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 PPFIA4O75335 1185 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 WISP1O95388 367 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 GYS1P13807 737 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 INPP5BP32019 993 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 IDH3AP50213 366 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 NRLP54845 237 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CEP120Q8N960 986 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ATG3Q9NT62 314 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 LTBP1Q14766 1721 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 M0R2N6 131 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CREB3O43889 395 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 PEX14O75381 377 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 RTN1Q16799 776 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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TMOD3-209ENST00000561136 CEP41Q9BYV8 373 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 BCORQ6W2J9 1755 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 FYB1O15117 783 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 SH3BP5O60239 455 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ACAD11Q709F0 780 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ALG2Q9H553 416 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 FOXN1O15353 648 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 PHKG2P15735 406 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 RASA1P20936 1047 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC96Q2M329 555 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 OGFOD1Q8N543 542 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 KLK14Q9P0G3 267 aa6.92□□□□□ -1.3
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TMOD3-209ENST00000561136 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 SLX4Q8IY92 1834 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 NFKBIEO00221 500 aa6.91□□□□□ -1.3
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TMOD3-209ENST00000561136 GHRHP01286 108 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ARSDP51689 593 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 UVSSAQ2YD98 709 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 JADE2Q9NQC1 790 aa6.91□□□□□ -1.3
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TMOD3-209ENST00000561136 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 MRC1P22897 1456 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 COL4A5P29400 1685 aa6.9□□□□□ -1.3
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TMOD3-209ENST00000561136 USP17L4A6NCW7 530 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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TMOD3-209ENST00000561136 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 FSTL1Q12841 308 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 MCM6Q14566 821 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CXorf38Q8TB03 319 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 EVI5LQ96CN4 794 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ASIC4Q96FT7 647 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 MYRFLQ96LU7 910 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.9□□□□□ -1.3
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