RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAMKK2Q96RR4 588 aa12.43□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP4F12Q9HCS2 524 aa12.43□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa12.42□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYOM1P52179 1685 aa12.42□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDE3AQ14432 1141 aa12.42□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 LDLRAD1Q5T700 205 aa12.42□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 SSH2Q76I76 1423 aa12.42□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA0232Q92628 1395 aa12.42□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 UNCXA6NJT0 531 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 TIAF1O95411 115 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 RASIP1Q5U651 963 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 FDX2Q6P4F2 183 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNB2Q92953 911 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 CBX8Q9HC52 389 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 TPSG1Q9NRR2 321 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPRASP1Q5JY77 1395 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa12.4□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRC14Q15048 493 aa12.4□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTBK2Q6IQ55 1244 aa12.4□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 BACH2Q9BYV9 841 aa12.4□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP8B1Q9UNU6 501 aa12.4□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 AKAP12Q02952 1782 aa12.4□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 NINLQ9Y2I6 1382 aa12.4□□□□□ -0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF862O60290 1169 aa12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 AOC2O75106 756 aa12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 PREPP48147 710 aa12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCARA3Q6AZY7 606 aa12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 LLGL2Q6P1M3 1020 aa12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR18Q9BV38 432 aa12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 RLBP1P12271 317 aa12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 LIG1P18858 919 aa12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPS26P62854 115 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 DOC2BQ14184 412 aa12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 UVSSAQ2YD98 709 aa12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAD18Q9NS91 495 aa12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM37O94972 964 aa12.37□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADH5P11766 374 aa12.37□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 LIG3P49916 1009 aa12.37□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa12.37□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 TP53INP1Q96A56 240 aa12.37□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.37□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPDO75976 1380 aa12.37□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL18A1P39060 1754 aa12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 SART1O43290 800 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 DRD2P14416 443 aa12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP3K11Q16584 847 aa12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGMOQ6ZNB7 445 aa12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM196AQ6ZSG2 479 aa12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARMC10Q8N2F6 343 aa12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM87AQ8NBN3 555 aa12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLIT3O75094 1523 aa12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 RECKO95980 971 aa12.35□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.35□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.35□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPBAR1Q8TDU6 330 aa12.35□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAPPAQ13219 1627 aa12.35□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIK3C2AO00443 1686 aa12.35□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHD4Q14839 1912 aa12.35□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP19O94966 1318 aa12.35□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLFN14P0C7P3 912 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 YY1P25490 414 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYRFLQ96LU7 910 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 RSRP1Q9BUV0 290 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 QRICH2Q9H0J4 1663 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHC3Q8NDX5 983 aa12.33□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF428Q96B54 188 aa12.33□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa12.33□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHRNA2Q15822 529 aa12.32□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERMP1Q7Z2K6 904 aa12.32□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 POGKQ9P215 609 aa12.32□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 NHSQ6T4R5 1651 aa12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.4 ms