RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	PDE4B	Q07343	736 aa		11.97	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		11.97	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.97	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		11.97	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	MCC	P23508	829 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR18	Q9BV38	432 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	HIP1	O00291	1037 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TLR2	O60603	784 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	IGSF3	O75054	1194 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		11.96	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CDC45	O75419	566 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC16A2	P36021	539 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ALX1	Q15699	326 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573		F5H6K3	240 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	NDUFB10	O96000	172 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	INHBE	P58166	350 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	KLRC3	Q07444	240 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	PORCN	Q9H237	461 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573		E7EWF7	191 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	SP3	Q02447	781 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	C17orf99	Q6UX52	265 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	MYL10	Q9BUA6	226 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	GABRQ	Q9UN88	632 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	TMX2	Q9Y320	296 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC27A2	O14975	620 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	PPFIA3	O75145	1194 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	FLOT1	O75955	427 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	RXRA	P19793	462 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	HERVK_113	P62684	666 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	PLS1	Q14651	629 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC17	Q96LX7	622 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	VCPKMT	Q9H867	229 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	FKTN	O75072	461 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	PSMC4	P43686	418 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	TTLL1	O95922	423 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	ANTXR2	P58335	489 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM227B-208	ENST00000559573	NECTIN1	Q15223	517 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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