RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 H3BQV1 296 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 GH2P01242 217 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF5BP33176 963 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAP2P40123 477 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 NTRK3Q16288 839 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFFO2Q5TF58 517 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFNAR1P17181 557 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEPT2Q15019 361 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDCA5Q96FF9 252 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 GINM1Q9NU53 330 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASNSP08243 561 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOVP48745 357 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 ICA1Q05084 483 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 DLK2Q6UY11 383 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-201ENST00000558831 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 WRNIP1Q96S55 665 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP3K14Q99558 947 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTMR6Q9Y217 621 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYH4Q9Y623 1939 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRM4Q14833 912 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 NYAP2Q9P242 653 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAD21O60216 631 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 GUCY1A2P33402 732 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 JAG1P78504 1218 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRKG1Q13976 671 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLRG1Q96E93 195 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 C8orf76Q96K31 380 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 GBP4Q96PP9 640 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALG1Q9BT22 464 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 F13A1P00488 732 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 IREB2P48200 963 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNAQP50148 359 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 GUCY1B3Q02153 619 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 NBPF11Q86T75 865 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 STAG2Q8N3U4 1231 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 WASF1Q92558 559 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAD2L2Q9UI95 211 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 STK36Q9NRP7 1315 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATAD5Q96QE3 1844 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP2O75604 605 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 DEXIO95424 95 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA8HP0CJ92 632 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 INPP5BP32019 993 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 NFKBIBQ15653 356 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L2Q6R6M4 530 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 FZD1Q9UP38 647 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L5A8MUK1 530 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 RASGRP2Q7LDG7 609 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 FERMT3Q86UX7 667 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCYL3Q8IZE3 742 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 MKL1Q969V6 931 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 AIFM3Q96NN9 605 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 PICK1Q9NRD5 415 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 V9GY48 417 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM29Q14134 588 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 MCTP1Q6DN14 999 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHADLQ6NUI6 762 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIBF1Q8WXW3 757 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 DOCK1Q14185 1865 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYH6P13533 1939 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLRF2D3W0D1 207 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBE2Q2LH0YL09 131 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAF5O00463 557 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDHBP11177 359 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms