RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558593.1

GABPB1-AS1-203, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GABPB1-AS1, Length 507 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.35□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 COMMD10Q9Y6G5 202 aa8.35□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 UFL1O94874 794 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PTSQ03393 145 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 WDR44Q5JSH3 913 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 STK32AQ8WU08 396 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.34□□□□□ -1.07
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TTC36A6NLP5 189 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCER2I3L3R5 266 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LGR5O75473 907 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 BBOX1O75936 387 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 VAMP1P23763 118 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DEKP35659 375 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CAP1Q01518 475 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C4orf17Q53FE4 359 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TBCELQ5QJ74 424 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FAM89AQ96GI7 184 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MAF1Q9H063 256 aa8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PPFIA4O75335 1185 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PLA2G4AP47712 749 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EPHA4P54764 986 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FOXK2Q01167 660 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TCIRG1Q13488 830 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PARP10Q53GL7 1025 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DPH6Q7L8W6 267 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NLRP10Q86W26 655 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CXorf38Q8TB03 319 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DPF2Q92785 391 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CLMNQ96JQ2 1002 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CFAP53Q96M91 514 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SREBF2Q12772 1141 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KRT24Q2M2I5 525 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 COPS6Q7L5N1 327 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NBPF11Q86T75 865 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DPF3Q92784 378 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EYA3Q99504 573 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 VPS33BQ9H267 617 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 USP3Q9Y6I4 520 aa8.31□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC35F4A4IF30 521 aa8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NF2P35240 595 aa8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TEAD4Q15561 434 aa8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SERTM1A2A2V5 107 aa8.29□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 F8W031 263 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms