RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 A0A1B0GUL7 405 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 KIF28PB7ZC32 967 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 CHL1O00533 1208 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 HOXB7P09629 217 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 HMGCS2P54868 508 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 MAP3K10Q02779 954 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 GRIK5Q16478 980 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 CCDC27Q2M243 656 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 RARBP10826 455 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 ACLYP53396 1101 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 KRT24Q2M2I5 525 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 SPRED2Q7Z698 418 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 SLC9A7Q96T83 725 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-225ENST00000551253 STXBP3O00186 592 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 TAF5LO75529 589 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 PGK1P00558 417 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 ZNF853P0CG23 659 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 GRB14Q14449 540 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 COL19A1Q14993 1142 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 IFT57Q9NWB7 429 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 ELP1O95163 1332 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 GNAI1P63096 354 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 CCNA1P78396 465 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 WWC1Q8IX03 1113 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 HYPKQ9NX55 129 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 DOCK1Q14185 1865 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 MBTPS2O43462 519 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 CD4P01730 458 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 NFIAQ12857 509 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 TTLL4Q14679 1199 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 WDR78Q5VTH9 848 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 DPP9Q86TI2 863 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 VWCEQ96DN2 955 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 HIPK3Q9H422 1215 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 IL16Q14005 1332 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 ARVCFO00192 962 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 ADAMTS4O75173 837 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 PFKMP08237 780 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 CCL23P55773 120 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 MIER1Q8N108 512 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 RUBCNQ92622 972 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 MBIPQ9NS73 344 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 TNKSO95271 1327 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 MYH3P11055 1940 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 ITGA6P23229 1130 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 LTBRP36941 435 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 ERVK-21P61565 698 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 GOLGA2Q08379 1002 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-225ENST00000551253 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms