RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	RLF	Q13129	1914 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	INHA	P05111	366 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ELN	P15502	786 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MORN1	Q5T089	497 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	RNF208	Q9H0X6	261 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	PORCN	Q9H237	461 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	CEP290	O15078	2479 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	PEX10	O60683	326 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	IGHD	P01880	384 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	HMGCR	P04035	888 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	NUCB1	Q02818	461 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	FOXP2	O15409	715 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	SGPL1	O95470	568 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	APP	P05067	770 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	HOXC6	P09630	235 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	DSG3	P32926	999 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	TDO2	P48775	406 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ALX1	Q15699	326 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MKL1	Q969V6	931 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	RPTOR	Q8N122	1335 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	STRN	O43815	780 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	TRIB2	Q92519	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	IGHA2	P01877	340 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	CYP2B6	P20813	491 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	PTPRE	P23469	700 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	RGS2	P41220	211 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	PDE4B	Q07343	736 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	APBA2	Q99767	749 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	NAPB	Q9H115	298 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	FGR	P09769	529 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	PPARA	Q07869	468 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	GRB14	Q14449	540 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137		F5H6K3	240 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	FLOT1	O75955	427 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	KLRC3	Q07444	240 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	MROH8	Q9H579	483 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
CS-223	ENST00000551137	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.67	□□□□□ -0.22

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