RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549258.5

SLC38A2-208, Transcript of solute carrier family 38 member 2, human

TSL 2

Gene SLC38A2, Length 4,384 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A2-208	ENST00000549258	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CPD	O75976	1380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	RREB1	Q92766	1687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	HAL	P42357	657 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SCRN1	Q12765	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ITPK1	Q13572	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CHD4	Q14839	1912 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ERLIN2	O94905	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	RBP3	P10745	1247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	HDAC4	P56524	1084 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CORO7	P57737	925 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	PIGB	Q92521	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CYP1A2	P05177	515 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ARPC4	P59998	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NUP98	P52948	1817 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	LAMB2	P55268	1798 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SGTA	O43765	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	BBOX1	O75936	387 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CP	P00450	1065 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ADD2	P35612	726 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NEK2	P51955	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CUL4B	Q13620	913 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SPACA7	Q96KW9	195 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	AFF2	P51816	1311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	DES	P17661	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CHML	P26374	656 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	KAZN	Q674X7	775 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68	2e-11	■□□□□ 10.3
SLC38A2-208	ENST00000549258	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SNAP23	O00161	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	BIN1	O00499	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	KDM1A	O60341	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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