RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 CUL5Q93034 780 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 IDI2Q9BXS1 227 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 AOX1Q06278 1338 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CXCL11O14625 94 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 IRF6O14896 467 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 KIF5BP33176 963 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SLC20A2Q08357 652 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TAF3Q5VWG9 929 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SLFN13Q68D06 897 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 OSBP2Q969R2 916 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CHD4Q14839 1912 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CACNA1SQ13698 1873 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 POTECB2RU33 542 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L15C9J2P7 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L11C9JVI0 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L18D6R9N7 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L22D6RA61 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L19D6RCP7 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L20D6RJB6 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TPM2P07951 284 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CAP2P40123 477 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L24Q0WX57 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TRIM29Q14134 588 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC174Q6PII3 467 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SPC25Q9HBM1 224 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 B4E1Z4 1266 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GAKO14976 1311 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ESPNB1AK53 854 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TMEM232C9JQI7 657 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 M0R2C6 588 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TTLL1O95922 423 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ALAS1P13196 640 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CST9Q5W186 159 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GBP4Q96PP9 640 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RAD50Q92878 1312 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 A0A0D9SFI3 127 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RASSF10A6NK89 507 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SLC10A3P09131 477 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 XBP1P17861 261 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF76P36508 570 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PSMC4P43686 418 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 MRE11P49959 708 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GINM1Q9NU53 330 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 STK24Q9Y6E0 443 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CYP2B6P20813 491 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 MCM5P33992 734 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 KIF3AQ9Y496 699 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CNTNAP1P78357 1384 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 AKR1B1P15121 316 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 FGAP02671 866 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CYP2C8P10632 490 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 BMP3P12645 472 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PTPRAP18433 802 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PLCD1P51178 756 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 MICU3Q86XE3 530 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms