RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	LIFR	P42702	1097 aa		19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	TFAP4	Q01664	338 aa		19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	EHD4	Q9H223	541 aa		19.01	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997		H7C1D1	291 aa		19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	CTDNEP1	O95476	244 aa		19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	SHMT1	P34896	483 aa		19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	IQCA1	Q86XH1	822 aa		19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		19	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	FIBP	O43427	364 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	WTAP	Q15007	396 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	APOA5	Q6Q788	366 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	FERMT3	Q86UX7	667 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	FAM151A	Q8WW52	585 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	CSRNP1	Q96S65	589 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	MTA3	Q9BTC8	594 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	ERICH2	A1L162	156 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	TSPY3	P0CV98	308 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	TSPY8	P0CW00	308 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	RXRA	P19793	462 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	DDX11	Q96FC9	970 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	MYL10	Q9BUA6	226 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	ELP1	O95163	1332 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	FAM83A	Q86UY5	434 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	SWAP70	Q9UH65	585 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	HACL1	Q9UJ83	578 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	CAVIN2	O95810	425 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	MICU3	Q86XE3	530 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	AP5Z1	O43299	807 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	MYH4	Q9Y623	1939 aa		18.96	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	CCDC69	A6NI79	296 aa		18.96	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	AKR1B1	P15121	316 aa		18.96	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	KRT85	P78386	507 aa		18.96	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		18.96	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		18.96	■□□□□ 0.63
BRF1-208	ENST00000546997	NT5C2	P49902	561 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	RASA3	Q14644	834 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	ZBTB43	O43298	467 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997		H3BQV1	296 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	PPFIA3	O75145	1194 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	MAP3K11	Q16584	847 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	IFFO2	Q5TF58	517 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	TMTC2	Q8N394	836 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		18.94	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	NEMF	O60524	1076 aa		18.93	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	CDC25B	P30305	580 aa		18.93	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	18.93	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	REST	Q13127	1097 aa		18.93	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	TNFAIP1	Q13829	316 aa		18.93	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		18.93	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	CEP95	Q96GE4	821 aa		18.93	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	TEPSIN	Q96N21	525 aa		18.93	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		18.93	■□□□□ 0.62
BRF1-208	ENST00000546997	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62

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