RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545392.1

TBK1-208, Transcript of TANK binding kinase 1, human

TSL 3

Gene TBK1, Length 408 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBK1-208	ENST00000545392	GBP1	P32455	592 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	CHMP4BP1	P59074	171 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	ERVFC1	P60507	584 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	MLEC	Q14165	292 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	HPX	P02790	462 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	DIRC2	Q96SL1	478 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	LRRC3	Q9BY71	257 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	GGT7	Q9UJ14	662 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TBK1-208	ENST00000545392	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	GREM1	O60565	184 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	BCL11A	Q9H165	835 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	SHISA3	A0PJX4	238 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	RGS13	O14921	159 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	RAP1GAP	P47736	663 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	ARSH	Q5FYA8	562 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	VWCE	Q96DN2	955 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	TSPAN15	O95858	294 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	RAG1	P15918	1043 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	GMIP	Q9P107	970 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	UBOX5	O94941	541 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	ATE1	O95260	518 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	CRK	P46108	304 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	OXR1	Q8N573	874 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	RNF4	P78317	190 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	SEZ6	Q53EL9	994 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	LILRA2	Q8N149	483 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	RNF32	Q9H0A6	362 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	KCNK12	Q9HB15	430 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	SP110	Q9HB58	689 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	UBP1	Q9NZI7	540 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	FITM1	A5D6W6	292 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	NFIB	O00712	420 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	TEK	Q02763	1124 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	GK5	Q6ZS86	529 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	TOX2	Q96NM4	488 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TBK1-208	ENST00000545392	C1QTNF9	P0C862	333 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	MCM4	P33991	863 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	CLC	Q05315	142 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	APOBR	Q0VD83	1088 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	DUSP4	Q13115	394 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	NR0B2	Q15466	257 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	KRT1	P04264	644 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	TMEM253	P0C7T8	217 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	ATG4C	Q96DT6	458 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	HDAC8	Q9BY41	377 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	EBF1	Q9UH73	591 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	CFP	P27918	469 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	ZNF165	P49910	485 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	CHRNE	Q04844	493 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TBK1-208	ENST00000545392	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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