RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		6	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		6	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		6	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM84A	Q96KN4	292 aa		6	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	6	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	FANCG	O15287	622 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	CILP	O75339	1184 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM37	O94972	964 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	EOMES	O95936	686 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	MPP2	Q14168	576 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	RASA3	Q14644	834 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNMB1	Q16558	191 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	SNTG2	Q9NY99	539 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	SAMM50	Q9Y512	469 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	MCM4	P33991	863 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	GIPR	P48546	466 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	CLCN7	P51798	805 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	CLC	Q05315	142 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	C12orf40	Q86WS4	652 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	PICK1	Q9NRD5	415 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	LMNB1	P20700	586 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	MLANA	Q16655	118 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	REC114	Q7Z4M0	266 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	KCT2	Q8NC54	265 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		5.96	□□□□□ -1.45
SNHG1-222	ENST00000545308	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	HSD3B2	P26439	372 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	AFM	P43652	599 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF165	P49910	485 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC14	Q15048	493 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	GK5	Q6ZS86	529 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	ENPP3	O14638	875 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	LRIG2	O94898	1065 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	CDK8	P49336	464 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	TNNI3K	Q59H18	835 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	FYB2	Q5VWT5	728 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	GPATCH3	Q96I76	525 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXQ1	Q9C009	403 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	ST7	Q9NRC1	585 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	LILRB2	Q8N423	598 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIN3B	O60391	1043 aa		5.93	□□□□□ -1.46

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