RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 ELNP15502 786 aa17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3-211ENST00000542667 HOXD10P28358 340 aa17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF333Q96JL9 665 aa17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3-211ENST00000542667 TANGO6Q9C0B7 1094 aa17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3-211ENST00000542667 PORCNQ9H237 461 aa17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3-211ENST00000542667 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3-211ENST00000542667 TMX2Q9Y320 296 aa17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3-211ENST00000542667 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
TM7SF3-211ENST00000542667 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 RGS19P49795 217 aa17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 MTFR1Q15390 333 aa17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 BTBD7Q9P203 1132 aa17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 MORF4L1Q9UBU8 362 aa17.08■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 PLXNB2O15031 1838 aa17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 EN2P19622 333 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 GRK4P32298 578 aa17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 ERVK-9P63128 1117 aa17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 ERVK-24P63145 666 aa17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 COA7Q96BR5 231 aa17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 VCPKMTQ9H867 229 aa17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 CLIP2Q9UDT6 1046 aa17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 RLFQ13129 1914 aa17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 ADCY3O60266 1144 aa17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 FGAP02671 866 aa17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 PRMT2P55345 433 aa17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 HAND2P61296 217 aa17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 TFAP4Q01664 338 aa17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 NBPF11Q86T75 865 aa17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 CEP95Q96GE4 821 aa17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 IL25Q9H293 177 aa17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 MYH4Q9Y623 1939 aa17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 CCDC171Q6TFL3 1326 aa17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 NMT2O60551 498 aa17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 TTC22Q5TAA0 569 aa17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 WDR78Q5VTH9 848 aa17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 GJD2Q9UKL4 321 aa17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 FLOT1O75955 427 aa17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 TSPY3P0CV98 308 aa17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 TSPY8P0CW00 308 aa17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 CYP2B6P20813 491 aa17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 PDE4BQ07343 736 aa17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 TRIM32Q13049 653 aa17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 COG2Q14746 738 aa17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 ATG4CQ96DT6 458 aa17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 SH2D4AQ9H788 454 aa17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 PARP14Q460N5 1801 aa17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 ALX1Q15699 326 aa17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 NBPF3Q9H094 633 aa17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 GOPCQ9HD26 462 aa17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 MTMR4Q9NYA4 1195 aa17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 F5H6K3 240 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 NDUFB10O96000 172 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 INHAP05111 366 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 CCL5P13501 91 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 DSG3P32926 999 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 KLRC3Q07444 240 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 PLS1Q14651 629 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 GPR142Q7Z601 462 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 NEDD1Q8NHV4 660 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 LPAR1Q92633 364 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM106CQ9BVX2 250 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 UNC93B1Q9H1C4 597 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF287Q9HBT7 754 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 IL17RBQ9NRM6 502 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 TOMM22Q9NS69 142 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 NYAP2Q9P242 653 aa17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3-211ENST00000542667 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3-211ENST00000542667 WDR46O15213 610 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3-211ENST00000542667 LBX2Q6XYB7 198 aa17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3-211ENST00000542667 RASGRP2Q7LDG7 609 aa17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3-211ENST00000542667 PLEKHH3Q7Z736 793 aa17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3-211ENST00000542667 TBC1D10CQ8IV04 446 aa17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3-211ENST00000542667 SLAIN1Q8ND83 568 aa17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3-211ENST00000542667 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3-211ENST00000542667 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3-211ENST00000542667 ANAPC4Q9UJX5 808 aa17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3-211ENST00000542667 MTMR7Q9Y216 660 aa17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms