RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536420.5

ACVR1B-204, Transcript of activin A receptor type 1B, humanhuman

TSL 4

Gene ACVR1B, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1B-204ENST00000536420 LPAR1Q92633 364 aa29.07■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.07■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 CCDC17Q96LX7 622 aa29.07■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 A0A1W2PRG0 241 aa29.06■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 MSCO60682 206 aa29.06■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 ATP2B2Q01814 1243 aa29.06■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 MB21D1Q8N884 522 aa29.06■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 GDF15Q99988 308 aa29.06■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 BCL11AQ9H165 835 aa29.06■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.06■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 COL6A1P12109 1028 aa29.05■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 LRRCC1Q9C099 1032 aa29.05■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 MBD4O95243 580 aa29.04■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 SHCBP1Q8NEM2 672 aa29.04■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.04■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 RLFQ13129 1914 aa29.04■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 PFASO15067 1338 aa29.03■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 C12orf60Q5U649 245 aa29.03■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 TMX2Q9Y320 296 aa29.03■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 FRMPD3Q5JV73 1810 aa29.03■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.02■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 CYP2D6P10635 497 aa29.02■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 EVX2Q03828 476 aa29.02■■■□□ 2.24
ACVR1B-204ENST00000536420 PRKAB2O43741 272 aa29.01■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 DPP9Q86TI2 863 aa29.01■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.01■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 DYNLL2Q96FJ2 89 aa29.01■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 SPATC1LQ9H0A9 340 aa29.01■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.01■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 FLRT1Q9NZU1 646 aa29.01■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 A0A0G2JMZ2 1700 aa29■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 USP17L12C9JPN9 530 aa29■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 USP17L21D6R901 530 aa29■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 DSG3P32926 999 aa29■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 CDK8P49336 464 aa29■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 ICA1Q05084 483 aa29■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 MROH8Q9H579 483 aa29■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 VCPKMTQ9H867 229 aa29■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 AKR1B1P15121 316 aa28.99■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.99■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.99■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 ABRAQ8N0Z2 381 aa28.99■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 NPLOC4Q8TAT6 608 aa28.99■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.99■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 IGHA2P01877 340 aa28.98■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.98■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 KANSL2Q9H9L4 492 aa28.98■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 LAMA3Q16787 3333 aa28.97■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 WDR46O15213 610 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 FLOT1O75955 427 aa28.97■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 ERCC3P19447 782 aa28.97■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 ADORA2AP29274 412 aa28.97■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 CNGA1P29973 690 aa28.97■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 GPR153Q6NV75 609 aa28.97■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 SYN1P17600 705 aa28.96■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.96■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.96■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 PARP14Q460N5 1801 aa28.96■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
ACVR1B-204ENST00000536420 CYP2C19P33261 490 aa28.95■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.95■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC25A27O95847 323 aa28.94■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 CYBAP13498 195 aa28.94■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 PLS1Q14651 629 aa28.94■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 LRIT3Q3SXY7 679 aa28.94■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 CTR9Q6PD62 1173 aa28.94■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.94■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 GPATCH3Q96I76 525 aa28.94■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 DNM1LO00429 736 aa28.93■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.93■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.93■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 TDHQ8IZJ6 230 aa28.93■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 ARRDC4Q8NCT1 418 aa28.93■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 GOPCQ9HD26 462 aa28.93■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.92■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 NCAPG2Q86XI2 1143 aa28.92■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 ATG4CQ96DT6 458 aa28.92■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa28.92■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 DNAH12Q6ZR08 3092 aa28.92■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 FCER1AP12319 257 aa28.91■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 SBK1Q52WX2 424 aa28.91■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.91■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.91■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 LRCH3Q96II8 777 aa28.91■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 DCTPP1Q9H773 170 aa28.91■■■□□ 2.22
ACVR1B-204ENST00000536420 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms