RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCNN1AP37088 669 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SP8Q8IXZ3 490 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FSD1Q9BTV5 496 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GGA1Q9UJY5 639 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.74□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP9BO43861 1147 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 REC8O95072 547 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C8orf34Q49A92 452 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EYA3Q99504 573 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HAUS7Q99871 368 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NOD1Q9Y239 953 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRP5O75197 1615 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L3A6NCW0 530 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L4A6NCW7 530 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL2RAP01589 272 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITGB2P05107 769 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGFR2P21802 821 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADORA1P30542 326 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TGFB2P61812 414 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC102BQ68D86 513 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STK32AQ8WU08 396 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLX4Q8IY92 1834 aa6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLIM4O00461 696 aa6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UFL1O94874 794 aa6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM193AP78312 1265 aa6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTSQ03393 145 aa6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SOGA3Q5TF21 947 aa6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTLL6Q8N841 843 aa6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPON1Q9HCB6 807 aa6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATG7O95352 703 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHMLP26374 656 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHKA1P46020 1223 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTF2IP78347 998 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPSM2P81274 684 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP3K12Q12852 859 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA5Q8NB90 893 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PIM2Q9P1W9 311 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.71□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHRNA5P30532 468 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GYG1P46976 350 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCNN1DP51172 638 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GDF10P55107 478 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms