RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 TMX2Q9Y320 296 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 RLFQ13129 1914 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 MYH4Q9Y623 1939 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 RAD21O60216 631 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 CNMDO75829 334 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 HOXD10P28358 340 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 Q3C1V9 767 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF333Q96JL9 665 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 FLT3LGP49771 235 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 PRMT2P55345 433 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 ERVK-9P63128 1117 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 ERVK-24P63145 666 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 PORCNQ9H237 461 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 SH2D4AQ9H788 454 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 PLXNB2O15031 1838 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 PARP14Q460N5 1801 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 POTEFA5A3E0 1075 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 FGAP02671 866 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 HAND2P61296 217 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 CEP95Q96GE4 821 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 IL25Q9H293 177 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 ELNP15502 786 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 PDE4BQ07343 736 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 ALX1Q15699 326 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 COA7Q96BR5 231 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 BTBD7Q9P203 1132 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 GRK4P32298 578 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 TFAP4Q01664 338 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 TICAM2Q86XR7 235 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 LPAR1Q92633 364 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 FLOT1O75955 427 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 TSPY3P0CV98 308 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 TSPY8P0CW00 308 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 RGS19P49795 217 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 MTFR1Q15390 333 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 ATG4CQ96DT6 458 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-211ENST00000531385 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 ADCY3O60266 1144 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 NBPF11Q86T75 865 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 NBPF3Q9H094 633 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 GOPCQ9HD26 462 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 NYAP2Q9P242 653 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 LAMA4Q16363 1823 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 HIP1O00291 1037 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 NMT2O60551 498 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 NDUFB10O96000 172 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 COG2Q14746 738 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 LBX2Q6XYB7 198 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 TOMM22Q9NS69 142 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 GJD2Q9UKL4 321 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 TSPY2A6NKD2 308 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 DSG3P32926 999 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 WDR78Q5VTH9 848 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 ZMYM6O95789 1325 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 F5H6K3 240 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 CYP2B6P20813 491 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 KLRC3Q07444 240 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 IRF5Q13568 498 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 GPR142Q7Z601 462 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 ORC4O43929 436 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 TTLL1O95922 423 aa22.22■■□□□ 1.15
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