RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 CAP1Q01518 475 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L24Q0WX57 530 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF22Q14807 665 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 GOPCQ9HD26 462 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 TOMM22Q9NS69 142 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 TTLL1O95922 423 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 HERVK_113P62684 666 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 PTH1RQ03431 593 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM17Q9Y577 477 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF6Q15052 776 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 MKL1Q969V6 931 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 EFCC1Q9HA90 598 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 NEDD4P46934 1319 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 CDC45O75419 566 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 CTGFP29279 349 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 NT5C2P49902 561 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 PLXNB2O15031 1838 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 NMT2O60551 498 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 GNRH1P01148 92 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMC4P43686 418 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 CASC1Q6TDU7 716 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 LBX2Q6XYB7 198 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 ESR2Q92731 530 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP4K1Q92918 833 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 F5H6K3 240 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 RAD21O60216 631 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 NDUFB10O96000 172 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 NOVP48745 357 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 KLRC3Q07444 240 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 COG2Q14746 738 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM47Q96LD4 638 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 STX8Q9UNK0 236 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP21A2P08686 494 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 FCGRTP55899 365 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 MYPNQ86TC9 1320 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 FLOT1O75955 427 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 ERVK-9P63128 1117 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 ERVK-24P63145 666 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 ABHD8Q96I13 439 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT23Q9C075 422 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 B4E1Z4 1266 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 PEX10O60683 326 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 KDM4AO75164 1064 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 DSG3P32926 999 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 CNMDO75829 334 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXD10P28358 340 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 PRMT2P55345 433 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 SLFN13Q68D06 897 aa22.42■■□□□ 1.18
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