RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520376.1

FBXW11-208, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 11, human

TSL 2

Gene FBXW11, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXW11-208	ENST00000520376	VCPKMT	Q9H867	229 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	PDE4B	Q07343	736 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	RAET1E	Q8TD07	263 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	ZMYM6	O95789	1325 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	PEX10	O60683	326 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF333	Q96JL9	665 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	GABRQ	Q9UN88	632 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXW11-208	ENST00000520376	HIP1	O00291	1037 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	ERVK-9	P63128	1117 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	ERVK-24	P63145	666 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	ALX1	Q15699	326 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	COA7	Q96BR5	231 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	LBX2	Q6XYB7	198 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	NBPF11	Q86T75	865 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	RGS19	P49795	217 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	GOPC	Q9HD26	462 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	CNMD	O75829	334 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	FLT3LG	P49771	235 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	NYAP2	Q9P242	653 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	FGA	P02671	866 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	TSPY3	P0CV98	308 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	TSPY8	P0CW00	308 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	GRK4	P32298	578 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	CEP95	Q96GE4	821 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	BRCA2	P51587	3418 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXW11-208	ENST00000520376	RAD21	O60216	631 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	FLOT1	O75955	427 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	IRF5	Q13568	498 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	COG2	Q14746	738 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376		Q3C1V9	767 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	PORCN	Q9H237	461 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	MAPK4	P31152	587 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	TFAP4	Q01664	338 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	BTBD7	Q9P203	1132 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	ADCY3	O60266	1144 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	INCENP	Q9NQS7	918 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	TSPY2	A6NKD2	308 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	ORC4	O43929	436 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	TTLL1	O95922	423 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	DSG3	P32926	999 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	CCNA1	P78396	465 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	POTEF	A5A3E0	1075 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	NDUFB10	O96000	172 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	ELN	P15502	786 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	HAND2	P61296	217 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	GPR142	Q7Z601	462 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	ATG4C	Q96DT6	458 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	GJD2	Q9UKL4	321 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	RAD50	Q92878	1312 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	FGR	P09769	529 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	MB21D1	Q8N884	522 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	IL25	Q9H293	177 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	TOMM22	Q9NS69	142 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
FBXW11-208	ENST00000520376		F5H6K3	240 aa		28.7	■■■□□ 2.18
FBXW11-208	ENST00000520376	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
FBXW11-208	ENST00000520376	KLRC3	Q07444	240 aa		28.7	■■■□□ 2.18
FBXW11-208	ENST00000520376	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
FBXW11-208	ENST00000520376	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		28.7	■■■□□ 2.18
FBXW11-208	ENST00000520376	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		28.7	■■■□□ 2.18

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