RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 DDB1Q16531 1140 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 BRAPQ7Z569 592 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 HOOK2Q96ED9 719 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 EHD4Q9H223 541 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 CDC23Q9UJX2 597 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.53□□□□□ -0.88
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TRPS1-209ENST00000519674 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 SH3GL2Q99962 352 aa9.52□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.52□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 H3BQV1 296 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 SPATA21Q7Z572 469 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRPS1-209ENST00000519674 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 SNAP23O00161 211 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-209ENST00000519674 CTDNEP1O95476 244 aa9.5□□□□□ -0.89
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