RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 CLIC6Q96NY7 704 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 LRP6O75581 1613 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM75PA6NK02 468 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF202O95125 648 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 YEATS4O95619 227 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 PDE6BP35913 854 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 GYS2P54840 703 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 PNMA1Q8ND90 353 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 MKL1Q969V6 931 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L3A6NCW0 530 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L4A6NCW7 530 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 KIF28PB7ZC32 967 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.91□□□□□ -0.98
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TRPS1-208ENST00000519076 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 MYO1CO00159 1063 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF174Q15697 407 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 CBX8Q9HC52 389 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.91□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.91□□□□□ -0.98
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TRPS1-208ENST00000519076 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.9□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.9□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.9□□□□□ -0.98
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TRPS1-208ENST00000519076 EYA3Q99504 573 aa8.9□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 STK32BQ9NY57 414 aa8.9□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINC1P01008 464 aa8.9□□□□□ -0.98
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TRPS1-208ENST00000519076 AFMP43652 599 aa8.9□□□□□ -0.98
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TRPS1-208ENST00000519076 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
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TRPS1-208ENST00000519076 DDR1Q08345 913 aa8.9□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.9□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
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TRPS1-208ENST00000519076 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
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TRPS1-208ENST00000519076 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 SLC39A14Q15043 492 aa8.89□□□□□ -0.99
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TRPS1-208ENST00000519076 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 CPVLQ9H3G5 476 aa8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 POLLQ9UGP5 575 aa8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 NPR1P16066 1061 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 TM4SF1P30408 202 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 GRIK5Q16478 980 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
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