RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 PGRP06401 933 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 CAP2P40123 477 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 ZAR1Q86SH2 424 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 NKD1Q969G9 470 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 SPATA32Q96LK8 384 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 NCOA1Q15788 1441 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 KIF3BO15066 747 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 PAK2Q13177 524 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 SEZ6Q53EL9 994 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 FBRSQ9HAH7 460 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 LGR6Q9HBX8 967 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 PLA2R1Q13018 1463 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 GATA6Q92908 595 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 GRIN3BO60391 1043 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 LRIG2O94898 1065 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 ATE1O95260 518 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 PLCG1P19174 1290 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 ADMP35318 185 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 GJA8P48165 433 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF165P49910 485 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 SLC6A19Q695T7 634 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 GPRASP2Q96D09 838 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 STRCQ7RTU9 1775 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 ADAM23O75077 832 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 HTR3BO95264 441 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 CDK5R2Q13319 367 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 NKG7Q16617 165 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 FBXL6Q8N531 539 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM87BQ96K49 555 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 FOXQ1Q9C009 403 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 PZPP20742 1482 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 F13BP05160 661 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 MCM4P33991 863 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 CYP27A1Q02318 531 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-225ENST00000515835 WDR64B1ANS9 1081 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 ITGB7P26010 798 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 ATG3Q9NT62 314 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 TNRQ92752 1358 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 CLCQ05315 142 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 NLRP1Q9C000 1473 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 FAM87AP0C7U9 286 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 TNNI2P48788 182 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 GK5Q6ZS86 529 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 SHISA5Q8N114 240 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-225ENST00000515835 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.19□□□□□ -0.94
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