RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC17Q96LX7 622 aa29.66■■■□□ 2.34
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ALYREF-203ENST00000511412 CDK8P49336 464 aa29.65■■■□□ 2.34
ALYREF-203ENST00000511412 C16orf86Q6ZW13 317 aa29.65■■■□□ 2.34
ALYREF-203ENST00000511412 ALPK3Q96L96 1907 aa29.65■■■□□ 2.34
ALYREF-203ENST00000511412 EVI5O60447 810 aa29.64■■■□□ 2.34
ALYREF-203ENST00000511412 CCL14Q16627 93 aa29.64■■■□□ 2.34
ALYREF-203ENST00000511412 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.64■■■□□ 2.34
ALYREF-203ENST00000511412 KBTBD3Q8NAB2 608 aa29.64■■■□□ 2.34
ALYREF-203ENST00000511412 LPAR1Q92633 364 aa29.64■■■□□ 2.34
ALYREF-203ENST00000511412 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
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ALYREF-203ENST00000511412 TSHZ3Q63HK5 1081 aa29.63■■■□□ 2.33
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ALYREF-203ENST00000511412 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.62■■■□□ 2.33
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ALYREF-203ENST00000511412 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.61■■■□□ 2.33
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ALYREF-203ENST00000511412 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.58■■■□□ 2.33
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ALYREF-203ENST00000511412 DSG3P32926 999 aa29.57■■■□□ 2.32
ALYREF-203ENST00000511412 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
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ALYREF-203ENST00000511412 SPATC1LQ9H0A9 340 aa29.57■■■□□ 2.32
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ALYREF-203ENST00000511412 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.57■■■□□ 2.32
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ALYREF-203ENST00000511412 NPLOC4Q8TAT6 608 aa29.54■■■□□ 2.32
ALYREF-203ENST00000511412 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa29.54■■■□□ 2.32
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ALYREF-203ENST00000511412 LHX8Q68G74 356 aa29.53■■■□□ 2.32
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ALYREF-203ENST00000511412 PRO3102Q9H379 93 aa29.53■■■□□ 2.32
ALYREF-203ENST00000511412 GOPCQ9HD26 462 aa29.53■■■□□ 2.32
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ALYREF-203ENST00000511412 MSCO60682 206 aa29.49■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 CYP2C19P33261 490 aa29.49■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 APPP05067 770 aa29.48■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 COL6A1P12109 1028 aa29.48■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 CNGA1P29973 690 aa29.48■■■□□ 2.31
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