RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC22Q5TAA0 569 aa25.04■■□□□ 1.6
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SH3BP2-210ENST00000505941 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 ARMC5Q96C12 935 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-210ENST00000505941 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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SH3BP2-210ENST00000505941 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.03■■□□□ 1.6
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SH3BP2-210ENST00000505941 GRK4P32298 578 aa25.02■■□□□ 1.6
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SH3BP2-210ENST00000505941 FLT3LGP49771 235 aa25.01■■□□□ 1.59
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SH3BP2-210ENST00000505941 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25■■□□□ 1.59
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SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.96■■□□□ 1.59
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SH3BP2-210ENST00000505941 BTBD7Q9P203 1132 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-210ENST00000505941 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-210ENST00000505941 RAD50Q92878 1312 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-210ENST00000505941 CNMDO75829 334 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-210ENST00000505941 NDUFB10O96000 172 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-210ENST00000505941 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-210ENST00000505941 FGRP09769 529 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-210ENST00000505941 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
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