RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ADAM11O75078 769 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 PPFIA3O75145 1194 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ALBP02768 609 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 RAB27AP51159 221 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ERVK-24P63145 666 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NKG7Q16617 165 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SV2AQ7L0J3 742 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 MTMR8Q96EF0 704 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 PICK1Q9NRD5 415 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 BLACEA4D250 179 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 KIF3BO15066 747 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 TMPRSS2O15393 492 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 GPR39O43194 453 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 AKAP10O43572 662 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 CLEC3AO75596 197 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ID3Q02535 119 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 STAT4Q14765 748 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SLC6A19Q695T7 634 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SMC5Q8IY18 1101 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 TRIM47Q96LD4 638 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 MTFR1LQ9H019 292 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.61□□□□□ -1.35
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HERC3-209ENST00000504994 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SHOXO15266 292 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 FANCGO15287 622 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 KPNA6O60684 536 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SLFN14P0C7P3 912 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 CPEP16870 476 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 GBP1P32455 592 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 UBE4AQ14139 1066 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 DHCR24Q15392 516 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 C14orf80Q86SX3 495 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 HID1Q8IV36 788 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 AHI1Q8N157 1196 aa6.6□□□□□ -1.35
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HERC3-209ENST00000504994 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 OPA1O60313 960 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 DLX3O60479 287 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NEFMP07197 916 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ATF3P18847 181 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NEK4P51957 841 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ITKQ08881 620 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 BIRC2Q13490 618 aa6.59□□□□□ -1.35
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HERC3-209ENST00000504994 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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HERC3-209ENST00000504994 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.59□□□□□ -1.35
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HERC3-209ENST00000504994 GBP3Q9H0R5 595 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SENP2Q9HC62 589 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.58□□□□□ -1.36
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HERC3-209ENST00000504994 ALAS2P22557 587 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TMPRSS15P98073 1019 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 NTRK3Q16288 839 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 MSL1Q68DK7 614 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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