RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.78■□□□□ 0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 C19orf81C9J6K1 198 aa15.77■□□□□ 0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 NECTIN1Q15223 517 aa15.77■□□□□ 0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.77■□□□□ 0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.77■□□□□ 0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.12
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PGGT1B-204ENST00000503638 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.77■□□□□ 0.12
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PGGT1B-204ENST00000503638 KRT32Q14532 448 aa15.76■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.76■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.76■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.76■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 NT5C2P49902 561 aa15.75■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.75■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.74■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.74■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 TBC1D8O95759 1140 aa15.74■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 TM4SF4P48230 202 aa15.74■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 VCPKMTQ9H867 229 aa15.73■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 PNMA3Q9UL41 463 aa15.73■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.73■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 SNX14Q9Y5W7 946 aa15.73■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.72■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 CYP2C8P10632 490 aa15.71■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 KLRC3Q07444 240 aa15.71■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 MOGSQ13724 837 aa15.71■□□□□ 0.11
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PGGT1B-204ENST00000503638 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.71■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.71■□□□□ 0.11
PGGT1B-204ENST00000503638 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.71■□□□□ 0.11
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