RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
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SPCS3-201ENST00000503362 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 PNMA1Q8ND90 353 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 CASP1P29466 404 aa14.86□□□□□ -0.03
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SPCS3-201ENST00000503362 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 FOXN1O15353 648 aa14.86□□□□□ -0.03
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SPCS3-201ENST00000503362 PTPREP23469 700 aa14.86□□□□□ -0.03
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SPCS3-201ENST00000503362 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.85□□□□□ -0.03
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SPCS3-201ENST00000503362 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.85□□□□□ -0.03
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SPCS3-201ENST00000503362 SIK1P57059 783 aa14.85□□□□□ -0.03
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SPCS3-201ENST00000503362 GOPCQ9HD26 462 aa14.85□□□□□ -0.03
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SPCS3-201ENST00000503362 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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SPCS3-201ENST00000503362 DPF2Q92785 391 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 CDC23Q9UJX2 597 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 ANTXR2P58335 489 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 NUP58Q9BVL2 599 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.84□□□□□ -0.03
SPCS3-201ENST00000503362 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
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SPCS3-201ENST00000503362 ST5P78524 1137 aa14.83□□□□□ -0.04
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SPCS3-201ENST00000503362 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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SPCS3-201ENST00000503362 VAV2P52735 878 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS3-201ENST00000503362 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPCS3-201ENST00000503362 UBE4AQ14139 1066 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS3-201ENST00000503362 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS3-201ENST00000503362 C8orf37Q96NL8 207 aa14.83□□□□□ -0.04
SPCS3-201ENST00000503362 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.83□□□□□ -0.04
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