RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 VPS54Q9P1Q0 977 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 CLIC4Q9Y696 253 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 CLRN2A0PK11 232 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 FAM196BA6NMK8 535 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 XBP1P17861 261 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 TNIP1Q15025 636 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 POLR3EQ9NVU0 708 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 TCP10L2B9ZVM9 353 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 PRELPP51888 382 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 SPDYE2Q495Y8 402 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 SLC35G1Q2M3R5 365 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 TATDN1Q6P1N9 297 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 RASGRP2Q7LDG7 609 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 CLEC10AQ8IUN9 316 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 NOSTRINQ8IVI9 506 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 LINC00301Q8NCQ3 95 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 PHF20Q9BVI0 1012 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 SPON1Q9HCB6 807 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 TTLL1O95922 423 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 SCG2P13521 617 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 NASPP49321 788 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 CLIP2Q9UDT6 1046 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 YEATS4O95619 227 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 LZTS2Q9BRK4 669 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 TRIM34Q9BYJ4 488 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 GOLGA8HP0CJ92 632 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 LIG1P18858 919 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC183Q5T5S1 534 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 ANO1Q5XXA6 986 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 PIBF1Q8WXW3 757 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 SYCE3A1L190 88 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 CYTH3O43739 400 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 USP17L2Q6R6M4 530 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 OXER1Q8TDS5 423 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 KLRF2D3W0D1 207 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 FAM151AQ8WW52 585 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 CSRNP1Q96S65 589 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 NR5A1Q13285 461 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 CNTNAP1P78357 1384 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 SHTN1A0MZ66 631 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 USP17L5A8MUK1 530 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 PDHBP11177 359 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 STK38Q15208 465 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 FKBP1CQ5VVH2 108 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 BICD2Q8TD16 824 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 MYOZ2Q9NPC6 264 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 FZD9O00144 591 aa30.01■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 ME1P48163 572 aa30.01■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 KCNG4Q8TDN1 519 aa30.01■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 SPZ1Q9BXG8 430 aa30.01■■■□□ 2.4
HOXB3-212ENST00000498678 WNT10BO00744 389 aa30.01■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 RPS12P25398 132 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 NPY5RQ15761 445 aa30.01■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa30.01■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 FAM43AQ8N2R8 423 aa30.01■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 PCDHA7Q9UN72 937 aa30.01■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 SPTLC2O15270 562 aa30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 SNHG28P0DPA3 235 aa30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 MMP14P50281 582 aa30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 VEZTQ9HBM0 779 aa30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 SMARCA1P28370 1054 aa30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 KRT2P35908 639 aa30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 NBPF9Q3BBW0 867 aa30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 LRSAM1Q6UWE0 723 aa30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 ZMYND15Q9H091 742 aa30■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 MYO1BO43795 1136 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 SLC39A14Q15043 492 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 CPVLQ9H3G5 476 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 KANSL2Q9H9L4 492 aa29.98■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 SH3GLB2Q9NR46 395 aa29.98■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 PTPAQ15257 358 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 ADALQ6DHV7 355 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 FAM83AQ86UY5 434 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 DACT1Q9NYF0 836 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 NYAP2Q9P242 653 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 ATP2B2Q01814 1243 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 ABCB5Q2M3G0 1257 aa29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms