RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	IRF5	Q13568	498 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	LPIN2	Q92539	896 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRA	P18433	802 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDX5	P30044	214 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	UTY	O14607	1347 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	FGFR2	P21802	821 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS3	P49796	1198 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	EYA2	O00167	538 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	ENTPD3	O75355	529 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PICALM	Q13492	652 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SKAP2-209	ENST00000497511	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGCR	P04035	888 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SYN1	P17600	705 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SIL1	Q9H173	461 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP8B	P34820	402 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511		Q7L0L9	218 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	GDF15	Q99988	308 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	AGER	Q15109	404 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	RPTOR	Q8N122	1335 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SIAH2	O43255	324 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	BTD	P43251	543 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	NR6A1	Q15406	480 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRC	P08575	1304 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PHKA1	P46020	1223 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SPP2	Q13103	211 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2B6	P20813	491 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGCS2	P54868	508 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXJ1	Q92949	421 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	MGAM	O43451	1857 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	GAK	O14976	1311 aa		13.39	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms