RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494136.1

LAMTOR4-212, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, humanhuman

TSL 2

Gene LAMTOR4, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4-212ENST00000494136 TOMM22Q9NS69 142 aa10.04□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.04□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.04□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa10.04□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.04□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 RAD50Q92878 1312 aa10.04□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 TSPY2A6NKD2 308 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 SDSP20132 328 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 GRK4P32298 578 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 GUCY1A2P33402 732 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 NT5C2P49902 561 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 SOX10P56693 466 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 ERVK-9P63128 1117 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 ERVK-24P63145 666 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 EVX2Q03828 476 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 PRKCZQ05513 592 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 TTC22Q5TAA0 569 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 LBX2Q6XYB7 198 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 DOCK3Q8IZD9 2030 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 STK11IPQ8N1F8 1099 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 FAM227BQ96M60 508 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 RLFQ13129 1914 aa10.03□□□□□ -0.8
LAMTOR4-212ENST00000494136 FLOT1O75955 427 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 TTLL1O95922 423 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 EEF2P13639 858 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 IRF5Q13568 498 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 COG2Q14746 738 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 ALX1Q15699 326 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 WDR78Q5VTH9 848 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CLEC10AQ8IUN9 316 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF333Q96JL9 665 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 NYAP2Q9P242 653 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 ANAPC4Q9UJX5 808 aa10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 ADCY3O60266 1144 aa10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 PRDM1O75626 825 aa10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 COPB2P35606 906 aa10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 FLT3LGP49771 235 aa10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CTNNA3Q9UI47 895 aa10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 A0A1W2PRG0 241 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 ORC4O43929 436 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 HMGCRP04035 888 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CAPN2P17655 700 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 TFAP4Q01664 338 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 VPS53Q5VIR6 699 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 NEDD1Q8NHV4 660 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CEP95Q96GE4 821 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC136Q96JN2 1154 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 DSCC1Q9BVC3 393 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 STX8Q9UNK0 236 aa10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 SMIM22K7EJ46 135 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF213O14771 459 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 FGAP02671 866 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 PDE4AP27815 886 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CTGFP29279 349 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 RGS2P41220 211 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 RGS19P49795 217 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CAP1Q01518 475 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 PLS1Q14651 629 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 CASC1Q6TDU7 716 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 GPR142Q7Z601 462 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 ESR2Q92731 530 aa9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR4-212ENST00000494136 APBA2Q99767 749 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms