RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 SCNN1DP51172 638 aa19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 LONRF3Q496Y0 759 aa19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 FAM13BQ9NYF5 915 aa19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 MYH1P12882 1939 aa19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 GNAQP50148 359 aa19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 ZNF75DP51815 510 aa19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 AOPEPQ8N6M6 819 aa19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 NEDD1Q8NHV4 660 aa19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 TNFRSF25Q93038 417 aa19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa19.18■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 H0YIN7 160 aa19.18■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 PLA2G4DQ86XP0 818 aa19.18■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 CNNM3Q8NE01 707 aa19.18■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 NLRP12P59046 1061 aa19.18■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 KRBA2Q6ZNG9 492 aa19.18■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 DRC7Q8IY82 874 aa19.18■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 DBNDD1Q9H9R9 158 aa19.18■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 PNOCQ13519 176 aa19.17■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP19.17■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 ISM2Q6H9L7 571 aa19.17■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 USP40Q9NVE5 1235 aa19.17■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 WNT7AO00755 349 aa19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 KIAA2012Q0VF49 1180 aa19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 CEP95Q96GE4 821 aa19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 CSRNP2Q9H175 543 aa19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 GOLGA8HP0CJ92 632 aa19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 ZNF174Q15697 407 aa19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 TTC38Q5R3I4 469 aa19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 STYK1Q6J9G0 422 aa19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 KCNQ5Q9NR82 932 aa19.16■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 CALML3P27482 149 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 CHRNA5P30532 468 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 SLC15A2Q16348 729 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 RASGRP2Q7LDG7 609 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 TEKT1Q969V4 418 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 TUBE1Q9UJT0 475 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 ADAMTS3O15072 1205 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 CYTH3O43739 400 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 SLC35G1Q2M3R5 365 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 SARM1Q6SZW1 724 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 PODNQ7Z5L7 613 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 FOCADQ5VW36 1801 aa19.15■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 BMP15O95972 392 aa19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 TPM3P06753 285 aa19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 BPIFA3Q9BQP9 254 aa19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 SH3GLB2Q9NR46 395 aa19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 KLRF2D3W0D1 207 aa19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 USP49Q70CQ1 688 aa19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 BLIDQ8IZY5 108 aa19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 PDILTQ8N807 584 aa19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.14■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 TOP1P11387 765 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 HHIPL2Q6UWX4 724 aa19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 LZTS2Q9BRK4 669 aa19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 FOXN1O15353 648 aa19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 CPVLQ9H3G5 476 aa19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 SERTAD1Q9UHV2 236 aa19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 PCDHA4Q9UN74 947 aa19.13■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 PTGS1P23219 599 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 GABPAQ06546 454 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 PTGDRQ13258 359 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 WWC2Q6AWC2 1192 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 TYW1BQ6NUM6 668 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 USP17L2Q6R6M4 530 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 FERMT2Q96AC1 680 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 KCNF1Q9H3M0 494 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 STK32BQ9NY57 414 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 CRKP46108 304 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 TRAPPC10P48553 1259 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 KIAA0825Q8IV33 1275 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 NRBP1Q9UHY1 535 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa19.12■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 CCDC186Q7Z3E2 898 aa19.11■□□□□ 0.65
TOM1-216ENST00000492723 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.7 ms